Eso se puede apañar en CoolReader cambiando un fichero de configuración. Hay un fichero para las pautas de "silabeo" (hypenization o como se diga en guiri). Si sustituimos el original por el que adaptó al español Solsticio para los Jinke/Papyre, entonces funciona correctamente el
silabeo de EPUB en Coolreader
Lo tienes explicado en
http://www.lectoreselectronicos.com/...-i62HD-Firefly