Gracias por la respuesta.
Ya había intentado ejecutar ADE, instalado en windows vista, usando wine, pero me da error de ejecución (serán cosas del windows vista y sus problemas con ejecución de programas con wine)
Finalmente he logrado instalar ADE en linux (opensuse 11.2) usando wine y funciona sin problemas.
He usado la última versión 1.7.1, curiosamente la otra vez que lo había intentado no funcionaba del todo bien, supongo que o bien han actualizado wine o el adobe digital editions, la cosa es que ya puedo comprar ebooks desde linux, eso si el ereader (iliber en mi caso) he tenido que activarlo desde el ADE de Windows, desde ese momento tan sólo con mover los archivos "a mano" ya pueden leerse.