Yo utilizo el AVS document converter para pasar los epub a doc. Da bastante buen resultado y es rápido e intuitivo.
http://www.avs4you.com/es/AVS-Document-Converter.aspx
Sin activación pone una marca de agua, pero creo que es solo en los PDF resultantes. Creo que en los Doc que sacaba de los epub no la ponía, pero tenía que hacer primero la conversión epub a pdf y luego repetirla de epub a doc y salia bien y rápido. De todas maneras yo lo he activado con la vacuna que hay por internet
Los Fb2 los paso cargo en el BookDesigner y luego selecciono el texto y lo pego en un word.