Biblioteca Calibre

[pepviv]

Cómo evitar que las carpetas y los epubs se guarden en la biblioteca con el título abreviado.

[milady133]

Pues depende a lo que te refieras. Si te refieres a como el programa Calibre guarda en tu ordenador los libros, no se puede cambiar, es una decisión de diseño de quien hizo el programa y es así, punto.
Si a lo que te refieres es a cómo guarda Calibre los libros en el Kobo, la estructura de carpetas y formato que crea en el Kobo sí que se puede personalizar. No tengo Calibre delante, pero hay un par de sitios donde indicas cómo debe enviar los libros al dispositivo, y ahí defines la carpeta y el nombre que le da al libro en el dispositivo. Hay un sitio genérico para todos los dispositivos (me parece recordar que tenía el nombre de metadatos o algo así), y los plugins específicos de Kobo (Kobo Touch o Kobo Touch Extended, depende de cuál uses) si no recuerdo mal también lo permiten especificar, y al conectar un Kobo esos plugins tienen prioridad sobre lo que hayas indicado en la otra opción de menú que es genérica para todos los dispositivos.