Si en el directorio raíz, (en donde normalmente se copian los libros. Realmente "desde dentro de koreader sería": "/mnt/onboard"), creas una carpeta llamada "fonts" y copias en ella todas las fuentes que te gusten, éstas te funcionarán en tanto en koreader, como en coolreader como en nickel. Un directorio para gobernarlos a todos :P xD
Edito: Lo tienes aquí: http://www.lectoreselectronicos.com/...tes-en-el-Kobo
Respecto a mejoras coolreader vs koreader. Bueno además de lo que te ha comentado danielr, tienes el visor de imágenes para por ejemplo ampliar un mapa en un epub (puedes rotarlo, ampliarlo y a su vez mover la zona magnificada), correcciones/mejoras en la parte de código que comparte con coolreader y que hacen que los epubs se muestren de una forma más correcta... y por contra probablemente coolreader sea un programa más ligero-eficiente (gaste menos batería) que koreader.