Los lectores de tinta electrónica están diseñados para consumir muy poca energía, lo que se traduce en dispositivos con la potencia muy justa, justo lo suficiente para mover mobis o epubs, consultar el diccionario y navegar por la lista de libros (si no hay muchos). Recuerdo los viejos Papyre, que tenían diccionario pero era un calvario intentar usarlo porque el dispositivo no tenía potencia para que pudiera usarse con normalidad.
Ese tipo de cosas para manejar pdfs que comentas necesitan de un procesador ágil, que consuma más que los procesadores disponibles en los lectores. Así que aunque encuentres algún lector o aplicación que te lo permita, el dispositivo lo manejará tan lentamente que puede llegar a ser frustrante.
Mejor que comprar un lector electrónico muy caro que te permita hacerlo todo (algunas cosas muy bien, otras no tanto), mejor gastarse ese dinero en un lector electrónico normalito y una tablet.