Sí, pero tiene su truco y no todo el mundo es capaz de hacerlo.
Compras el libro en Amazon. Eliminas la protección anticopia (se puede hacer instalando un
plugin en Calibre), luego conviertes el libro del formato en que esté (mobi o azw3) a epub o kebup usando Calibre de nuevo.
Con ese método puedes pasar a tu Kobo todos los libros que ya hayas comprado en Amazon y los que compres en el futuro.
Aunque para los libros nuevos existe otra opción: comprar los libros en otras tiendas que no sean Amazon, como la propia tienda de Kobo. Lo más probable es que los precios sean similares.