El formato ePub es un estándar, libre y de código abierto, otra cosa es que sea el formato que ha usado Adobe para añadirle una capa de DRM y de esta manera poder vender libros con protección en muchas de las tiendas de libros electrónicos.
Wikipedia Español: http://es.wikipedia.org/wiki/EPUB
Wikipedia Ingles con mas información: http://en.wikipedia.org/wiki/EPUB
Aquí puedes encontrar las especificaciones de la última versión del formato ePub:
http://idpf.org/epub/30